Территория
Территория сельского поселения Рапатовский сельсовет расположена в южной части муниципального района Чекмагушевский район. С южной части граничит с сельским поселением Калмашбашевский сельсовет, с севера — с сельским поселением Чекмагушевский сельсовет, с востока — с сельским поселением Урнякский сельсовет, с запада — с сельским поселением Новобалтачевский сельсовет. От районного центра с.Чекмагуш расположена в 9 км. Площадь земель населенных пунктов составляет 272 га, земли лесного фонда 1172 га, земли сельскохозяйственного назначения 7266 га.